Sejlads med motor på Furesøen, herunder også el-drev, er underlagt Naturstyrelsens regler. Der kan gives tilladelse til hjælpemotor for større sejlbåde (længde max. 6 m). Hjælpemotoren må kun benyttes til bugsering i havnen og ved hjemsejlads i tilfældet af pludseligt opstået vindstille. Sejljoller kan i almindelighed ikke opnå hjælpemotortilladelse, idet disse kan padles i havn.
YF råder over 38 såkaldte "fulde" motortilladelser til motorbåde. Nogle af dem er reserveret til klubbens motorbåde, men de øvrige stilles til rådighed for klubmedlemmernes private motorbåde. Der er dog venteliste for dem, som ønsker en motortilladelse til motorbå. Der kan i øjeblikket påregnes ca. 5 års ventetid. Udover ovennævnte 38 motortilladelser råder YF over 4 tilladelser til 100% el.